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LebencWissenschaftscBezeichner Nahmen Spezifikation An 5 7 Einleitung In den Lebenwissenschaften gibt es viele unterschiedliche Arten Wesen, die analytisch manipuliert werden. Gewöhnlich jede Art von Wesen hat ein mindestens "Bezeichner" Attribut, das für Kennzeichnung verwendet wird, z.B. eine Akzessionsnummer GenBank. Vorgeschlagen Spezifikation füllt den Abstand, in dem es kein allgemeinhin angenommenes System für das Zuweisen und das Erkennen der Bezeichner im Leben gibt Wissenschaftsgebiet. Die Ausgabe ist für die Analyse und die Verarbeitung von Daten vom Hochdurchsatz besonders wichtig Techniken, wie DNAMICROARRAYS, Proteinreihen und Massenspektrometrie. Ein Beispiel (Gebrauchfall): Die vor kurzem anerkannte Genausdrucksspezifikation (formal/2003-02-03) holt Normierung zum microarray Gen Ausdruck experimentiert durch die Definition des Formats Mage-ml XML. Eine der Schlüsseldesigngrundregeln von MAGE ist, daß ein Bezeichner Wesen, wie Reihen, ArrayDesigns, Reihenfolgen, Hybridationen beziehen kann, und Mittel. Dieses erlaubt, daß die Stücke eines Genausdrucksexperimentes in den unterschiedlichen Akten oder in den Datenquellen definiert werden und dann verwiesen in anderen Akten oder in Datenquellen. , dieses Bezeichnerkonzept völlig zu verwenden, muß es Vereinbarung über die Syntax des Bezeichners geben, damit Software kann erkennen Sie u. benutzen Sie die konstituierenden Teile. Für viele identifizierbare Wesen in MAGE, gibt es bereits weithin bekanntes ad hoc Namengeben Quellen, die verwendet werden können, z.B. GenBank, ATCC, NCBI-Taxonomie. In einer Bemühung, das Bezeichnerproblem zu adressieren, a Antrag wurde für die Anträge gebildet, die einen Satz Schnittstellen, Datenstrukturen und Dienstleistungen, die, definieren das einzigartige ermöglichen Namengeben u. Auflösung der Lebenwissenschaftswesen in einer systematischen Weise. Diese Spezifikation hofft, die Punkte anzusprechen, die oben beschrieben werden. Ein UML-Diagramm kann die vollständige Antwort zusammenfassen: |  |
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